Хм-м, я не встречал никаких программ и алгоритмов, которые справлялись бы на 100% со знаками пунктуации. Сам пишу в ворде, но у меня есть "чуйка". И ее легко наработать, если много читать. Спорные моменты возникают, но тогда лучше найти соответствующее правило или тред в интернете, и это запомнится лучше, и будет работать впредь. Должен сказать, я не противник автоматизации, совсем нет, но я не встречал еще ни одного сервиса, который бы удовлетворял мои запросы касательно граматики и пунктуации лучше стандартного Ворда. Однако теперь твердо намерен проверить некоторые приведенные здесь ссылки, спасибо.